Dysponuje jedną z najbogatszych w kraju kolekcji ikon. Tworzą je przedstawienia na desce, jak też ikony odlewane w metalu. Najstarsze wizerunki pochodzą z XVII w., przy czym przeważająca część zbioru datowana jest na XVIII, XIX i początek XX w. Absolutnym unikatem są szesnastowieczne freski ocalałe ze zburzonej i obecnie odbudowanej cerkwi Zwiastowania NMP, znajdującej się na terenie monasteru supraskiego.

Muzeum Ikon w Supraślu zajmuje północną część XVII-wiecznego pałacu archimandrytów, wchodzącego w skład monasteru Zwiastowania NMP. Jest pierwszą tego typu placówką w kraju. Niekonwencjonalna scenografia wnętrz, pełna nieoczekiwanych rozwiązań i multimedialnie przekazywanych treści, pobudza percepcję odbiorców i skłania do aktywnego zwiedzania. Prezentacja ok 350 ikon daje możliwość szerokiego zapoznania się z różnorodnością tematyki przedstawień, stylów i technik wykonania. Zastosowanie nowoczesnych technologii powoduje, iż Muzeum jest atrakcyjne nawet dla najbardziej wybrednego odbiorcy.